【生化学】HIVのほとんどの株を中和できるPG9抗体を結合したgp120エピトープの構造　糖ペプチド複合体を認識しV1/V2中の多様性を回避

1 ：11/12/18 〜 最終レス ：11/12/31

Highlights： 構造生物学：抗体を結合したgp120エピトープの構造
HIV-1のgp120エンベロープ糖タンパク質の可変領域V1/V2に見られる顕著な配列
多様性とN結合型糖鎖付加は、抗体による認識を回避する能力をウイルスが持つ
ことをよく示している。また、この部分は今まで構造決定が成功していなかった。
今回、P Kwongたちは、HIVのほとんどの株を中和できるPG9という抗体を用いて、gp
120のV1/V2の原子レベルの構造を決定した。PG9は、gp120の大部分を抗体に認識
されないように隠しているN結合型グリカンに惑わされることなく、N結合型グリカンを使って
結合しており、この結合機構はHIV中和に有効性を発揮する複数の抗体が共有して
いるものである。
この構造から、PG9は糖ペプチド複合体を認識し、水素結合などの、配列に依存しない
相互作用を作り出すことでV1/V2中の多様性を回避していることが明らかになった。
Nature ハイライト Nature 480, 7377 (Dec 2011)
http://www.natureasia.com/japan/nature/updates/index.php?i=86353
Structure of HIV-1 gp120 V1/V2 domain with broadly neutralizing antibody PG9
Jason S. McLellan et al.
Nature 480, 336–343 (15 December 2011) doi:10.1038/nature10696
http://www.nature.com/nature/journal/v480/n7377/abs/nature10696.html
Figure 3: PG9–V1/V2 interactions.
http://www.nature.com/nature/journal/v480/n7377/images/nature10696-f3.2.jpg
Crystal Structure of PG9 Fab in Complex with V1V2 Region from HIV-1 strain CAP45
http://molvis.sdsc.edu/fgij/fg.htm?mol=3U4E
Crystal Structure of PG9 Fab in Complex with V1V2 Region from HIV-1 strain ZM109
http://molvis.sdsc.edu/fgij/fg.htm?mol=3U2S
Crystal Structure of PG9 Fab
http://molvis.sdsc.edu/fgij/fg.htm?mol=3U36
Crystal Structure of HIV-1 Neutralizing Antibody CH04
http://molvis.sdsc.edu/fgij/fg.htm?mol=3TCL
CH04H/CH02L P212121
http://molvis.sdsc.edu/fgij/fg.htm?mol=3U46
CH04H/CH02L Fab P4
http://molvis.sdsc.edu/fgij/fg.htm?mol=3U4B
Crystal structure of human Fab PGT145, a broadly reactive and potent HIV-1 neutralizing antibody
http://molvis.sdsc.edu/fgij/fg.htm?mol=3U1S
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2 ：

2ゲット

3 ：

なんのこっちゃ？
これだけ理解できない文章の羅列をみるのも珍しい

4 ：

よかったな
来世は治るかもよ

5 ：

良かったじゃないか

6 ：

コクーンのルシをパージみたいなもんだな

7 ：

ようするに今よりいい薬ができそう、もしくは治せそうな物質が発見されたって事だろ
まあHIV利権がものすごいから完治はできてもさせないと思うがな、いろんな団体が

8 ：

>>7
癌や糖尿病の特効薬は既に出来ているが、企業の陰謀で公表されていない・・
なんかと同レベルの幼稚な発想だな。
こういう馬鹿な陰謀論を信じ込む奴は、現代のアカデミズムのシステムを全く
理解できていない底辺層。

9 ：

えー色んな形状のHIVに対応できるアダプターが見付かったとか何とか？

10 ：

ようやく構造体解析のキーが見つかったか
先は長いが偉大な一歩だ

11 ：

どうせ亜種が増えまくっててイタチごっこになるんでしょ

12 ：

>>3
ネイチャーの日本語版のハイライトの訳は良く出来てるよ。
専門用語もエピトープと株とタンパクの固有名詞の記号以外は現代人が知っておくべきレベル。

13 ：

>>8
製薬業界の利益率は異常
それを守っているのが
製薬会社から多くの献金を貰っている
族議員
この構造はどんな業界にもある

14 ：

>>13
その異常な利益率とは具体的にどれくらいなのか？
その利益率は他の業界と比べて突出しているのか？
馬鹿がカビの生えたような古い知識を聞きかじって知ったかぶりしてんじゃねーぞコラ。
１つの新薬開発に１０年１５０億かかる業界で、原価と売価の単純な関係性で利益率なんか
語れる訳がない。
しかも製薬業界から多額の献金をもらってる族議員ってどこのだれだよ。

15 ：

ウィルスを抑えこむ事ができるって話か？
ウィルス自体をやっつける治療法の発見ではなく、
ウィルスの変化を阻止する治療法で延命治療が可能になったって事ですか。

16 ：

>>14
業界別利益率ランキングにあらわされるような決算上の利益率かによるが、
国内の業種別ではやはりトップレベルだな
ITや銀行みたいに利益率が高いイメージの業種より高い。
製造関係はもう利益率とかいうレベルじゃないから比較すらできんけど。
製薬業界が嫉妬されるのは、利益率が高いという要素もあるけれど
基本的人権を支える業種であるために、保護もしくは規制されている様が
一般人にわかりにくいからだろう。
保護なのか規制なのか、いずれにしても立法次第で業界の利益率が増減することは確かだ。

17 ：

>>14
ついでにもう一つ、
> しかも製薬業界から多額の献金をもらってる族議員ってどこのだれだよ。
どこのだれかを特定する必要はないだろう。
一般に厚生族として振舞っている議員達で充分じゃないか？
http://www.kcn.ne.jp/~ca001/A84.htm

18 ：

怪我したら抗破傷風ヒト免疫グロブリンを注射
B型肝炎の人の針刺し事故では抗HBsヒト免疫グロブリン
　　　　　　↓
HIVキャリアとよからぬことをしたらPG9
というようになる可能性は十分ありそうなのかな

19 ：

>>17
いや特定する必要はあるだろう
憶測の域を出ないんじゃどこまで行っても尤もらしいフィクション

20 ：

pg9という酵素がHIVウイルスの維持に関与している感じか。
HIVが変化してもHIV自体はpg9によって原型を維持してる感じか。
pg9が働かなくなったら人間の免疫細胞も働かなくなる事を考えたらゾッとします。
HIVウイルスのシステムを人間が免疫抗体のシステムとして使うならバイ菌に人間がされなくなる日がくるかもしれない。

21 ：

こち亀の両津が持ってる抗体がＨＩＶみたいなやつだった
アニメのバイ菌のイメージがＨＩＶになるな

22 ：

>>14
例えば、薬島薫
笑い男事件関係で全て、露見した

23 ：

>>16
http://gyokai-search.com/2nd-ranking.htm
パR（製造）13.7％
インターネット 11.8％
製薬 9.7％
携帯電話 8.6％
銀行 7.7％
突出して高い、とはいえないよ。

24 ：

PG9は色々使えそうな感じだね

25 ：

>>17
馬鹿が追い詰められて今度は逃げ腰かよ・・・
厚生族議員＝製薬業界から献金を受けてる議員とか、小学生レベルの認識だな。
お前が貼ったそのリンク先に書いてあるのは日本医師会寄りの議員の話だろうが。
日本医師会の基本スタンスは診療報酬確保の為に医療費高騰の責任を他（例えば薬剤費）に転嫁する事であって、
お前の主張とは対局なんだが。
ま、お前が無知なのは大変良く分かった。余計な事書くから恥の上塗りだったな。ご苦労。

26 ：

かわいいむっちむちの女子高生がHIVだったりするとがっかりだよな！

27 ：

>>23
>>23
パR インターネットの次に製薬だぞ
突出して高いだろjk sk
>>25
リンクは参考までに貼ったまで
ちゃんと製薬業界の政治連盟があってな、
そこからの公式なアピールを実現させるために
大手製薬会社から大金が出る仕組み。
金は単純に献金で出て、要求が政治連盟からくる、3店方式。
いたって普通。
政治と行政で利益率が決まる業界で金が出ないと考えるような幼稚な奴がいるとは思わなかったよ。
出ていない、もしくは少額という根拠があるならむしろ出してくれ。

28 ：

>>27
そのリンクが何の「参考」になっているのか教えて欲しいもんだが。
「厚生族議員」＝製薬業界から献金を受けてるんじゃなかったのか？
＞政治と行政で利益率が決まる業界で金が出ないと考えるような幼稚な奴
ここまでのカキコの中のどこに「金が出ない」と書いてある？勝手な思い込みで
なにムキになってるんだ？
そもそも「政治と行政で利益率が決まる」とか書いてるが、お前、医薬品の製造承認〜販売の課程で
どの様に許認可が行われ、価格が決められ、流通販売の課程でどうやって利益が発生していくのか、そのシステムもよく分からないまま
書き込んでるだろ。

29 ：

>>28
「厚生族議員」は製薬業界から献金を受けているよ？
受けていないとでも？
> 、そのシステムもよく分からないまま書き込んでるだろ。
そのシステムが何か？
薬価の決定そのものが利権だろ。

30 ：

>>27
＞突出して高いだろjk sk
パRより3％、インターネットより2％も利益率が低くて「突出」ですか。
随分とおかしな日本語使うやつだなぁ。

31 ：

でっかい釣り針だなーｗｗ
どんだけ業界があると思ってんだよｗ
違法ぎりぎりの3店方式の業界と
きょうびこれ以上ない利益をあげてるインターネットより低いとか
バカ丸出し

32 ：

>>1
まったく分からんががんばってほしい。

33 ：

>>31
＞きょうびこれ以上ない利益をあげてるインターネットより低いとか
なにが「バカ丸出し」なのか知らないが、
インターネット業界より利益率低いのに、なんで「突出」なんだ？
インターネット業界は製薬業界よりもっと族議員に献金してんのか？

34 ：

現代科学ではゴキブリの全滅はムリですか？

35 ：

↓この画像を見る限り、エイズは有色人種の駆除装置なんだろう
http://uou.jp/2ch/?idx=216.jpg

36 ：

>>33
あらら、厨二病ですか。
薬、効きませんね

37 ：

>>36
と、答えられないのでレッテル貼りにいそしむ、と。

38 ：

お約束
HIVウィルス禁止
遅いか。
HIV: Human Immunodeficiency Virus

39 ：

>>37
あほか、利益率トップ50の中ですら、偏差値73、中央値2.75の3倍。
全業種で見ればさらにすごいことになる。
1位以外は突出じゃないとか小学生じゃあるまいし。

40 ：

>>39
そりゃ、今が不景気で他の業界の利益率が低いから
「景気に左右されない」のが売りな製薬業界が比較的マシになってるだけだろ。
液晶テレビ買わなくても花粉症の薬は買うからな。

41 ：

長期的に利益が上がり続けるから利権が根付く。
その利権を守るためなら消費者に害が及んでも問題にしないという利権複合体が問題なわけ。
言わせんな恥ずかしい

42 ：

エイズは片付いたように思われたが。
今日のは誰だ

43 ：

で、>>40氏は、製薬業界は献金していないという主張なの？

44 ：

>>41
散々、副作用で突っ込まれてますが。
>>43
してるんじゃないの？
その業界が、その業界を盛り立てるために適切な政党に献金するのは当たり前のことだろ。

45 ：

>>44
副作用で突っ込まれてる？
バカなのね。
副作用があることは突っ込みの対象じゃない。
害があるとわかっていて、それを隠したりで実害が発生して初めて問題。

46 ：

>>45
だから、そういう問題で突っ込まれてるだろ？
で、そういう問題があるのはどの業界でも同じだろ？
コンビニやスーパーでも時々「賞味期限切れのものを売ってた」とかあるだろ。
そのコンビには利権複合体によって政治と癒着してたから賞味期限切れのものを売ってたのか？

47 ：

>>44
なんだ、じゃ、特に争点もなく、釣りたかっただけなのね。オツカレ

48 ：

>>47
ん？
別に「献金なんて無い」なんて一度も主張したことはないし、
献金があったからといって即、利権で不正が隠されているというわけでもないし、
ましてや>>7のような幼稚な陰謀論が成り立つはずがないと思ってるだけだよ。

49 ：

>>46
> そういう問題
そういう問題って薬害のことか？
薬害と賞味期限切れのものを売ることの構造的違いがわからない子なのね。

50 ：

>>48
あー、まぁ、完治させないとかいう幼稚な陰謀論はありえんだろうな。
しかしね。
> 献金があったからといって即、利権で不正が隠されているというわけでもないし、
即とは言わないが、薬害エイズを生んだ理由の一つが利権であることは間違いない。

51 ：

>>49
具体的に「構造的違い」ってのを説明してみな。
>>50
そうだね。そしてそれは暴かれて会社が潰れたね。
まー、どの業界でもよくある話のひとつだな。

52 ：

>>51
薬害：
薬の承認に医師・官が必要で、そこに利権がからむから不正が可能
コンビニの賞味期限切れ：
店舗単独のモラルの問題。賞味期限切れを修正すれば詐欺の可能性もある。

53 ：

>>52
単なる手続きの問題だろ？
店長のハンコをもらうか、役人のハンコをもらうか、の違い。
それを「構造的違い」って言ってるわけ？
なにも利権だの何だの持ち出す必要は無いだろ？
単に「金を節約したかったから、関係者で口裏合わせました」ってだけのこと。
そうじゃなくて、どういう利権の構造があり、それが製薬業界の特殊な事情であるかを説明しなくちゃ何の意味も無いじゃん。

54 ：

>>53
> どういう利権の構造があり、それが製薬業界の特殊な事情であるか
> 説明しなくちゃ何の意味も無いじゃん。
それを説明して何の意味がある？

55 ：

>>54
単に一部の人間が欲に駆られたのではなく、
必然的にそういう腐敗をもたらす「構造的要因」があってこそ
「だから製薬会社は〜」と一般化することが可能になる。
単に「金に汚い奴が役人と結託して粗悪品を世の中に出した」じゃ、どの業界にもある話でしかないだろ？
それともなにか？
あんたは「大人って汚い」みたいなことを言いたいだけか？

56 ：

>>55
十分に一般化してるし、これが構造だけど？
> 薬の承認に医師・官が必要で、そこに利権がからむから不正が可能

57 ：

ま、釣り師が釣られた段階で負けだな。
俺は寝るｗｗ

58 ：

>>56
だから、それは「医者や役人も一緒になってやった」ってだけの話だろ？
どうして役人も一緒になったのか、その役人だけが悪人だったのか、
それともノルマとか役所の仕組みで汚職をしなければならない構造だったのか、
そういのが「構造」なんだよ。
あんたは単に「利権が絡む」とか言ってれば世の中が判ったような気になってる中二病に過ぎないよ。

59 ：

SSRIを何とかしてくれよ
隣のが精神科にSSRIもらってるけどいきなり噛みつかれて
ほんとまいったわ

60 ：

>>58
厨二病っていうのは、
> だから、それは「医者や役人も一緒になってやった」ってだけの話だろ？
こういう理解しかできないでキャンキャンわめくことを言うのです。

61 ：

>>60
だからね、構造的な問題ってのはどういうことなのかを良く考えな。
「薬の承認に医師・官が必要」ってだけでは、
「では、それだけ厳しいチェックが行われているんだ」ということも可能なんだよ。
「利権が絡む」の部分を「〜だから〜という仕組みで汚職がはびこる」というように見なければ何も言ってないんだよ。
構造的っていうのはさ、例えば交通事故が起きたとする。
「信号機も無いし、視野が壁でふさがれているから横から自動車が来ても分からないね」
これが「構造的な問題」ってわけ。事故は必然的に起きるだろっていう。
あんたが言ってるのは「タクシーとトラックがぶつかって玉突き事故が起きた」ってだけの話。
これで「構造的な問題があった」って言っても誰も納得しないだろ？

62 ：

>>61
で、おまいさんは、
製薬会社、官、医師の間に構造的な問題はないと主張したいのかね？
突っかかるだけなら、小学生でもできる。

63 ：

ついにロチャニをべラルゴしたのか。
ベラルゴしたロチャニはとてもベテデビしてジョジラフトってしまうが、
グリドバグマることが可能ということだな。

64 ：

>>62
知らんよ。だから説明を求めてるんだけど？

65 ：

>>64
知らないなら黙ってろよ。
ここは質問板じゃない。

66 ：

問題があるなら説明すればいい
説明せず印象操作をしてるのは893と同じ
本人は頑張ってるつもりだろうが旗から見りゃ一目瞭然
コラとか言ってる阿呆の言うことなんて誰も信用しねーよｗｗ
つーか逆の意味で信用性上がるわｗｗ

67 ：

なんか、勝手にFUDだと勘違いしているバカもいるのか。
製薬業界が1位に負けてるから突出してないとか小学生みたいなこと書いてるから
偏差値を計算してやったけど、それもサービスな。
で、俺は >>46がバカげたことを書いてるから、
コンビニの賞味期限切れと薬害には構造的違いがあると言った。
基本的な違いについてはしょうがないので書いてやったが、
詳細に説明してやる義理はない。
で、構造的違いがないと思ってるの？というとそうでもない。知らないと言う。
アホかと。
バカなふりをしてる間にホントにバカになるから注意しとけよ。

68 ：

>>67
偏差値がどうとか、それは単にその業界がその時点で優秀だってことでしかない。
ただそれだけのこと。
で、構造的に何か問題があるのか？と聞いてみたら「利権が」と繰り返すばかりで
その利権の中身を説明できない。
単に「医者と役人の承認を必要とする」では「審査が煩雑」ってだけのことでしかない。
それで「だから問題がある」といわれても、それは「世の中って汚い」って言ってるだけに聞こえてしまうんだよ。

69 ：

>>68
そこまで言うなら、薬害に構造的問題はなかったと主張すればいい。
自分は何も主張せずに突っかかってもなぁ

70 ：

>>68
その業界の利益率が突出しているか否かという命題、
突出しているかどうかは一般に偏差値ベースで比較する。
一位に数％負けているという理由で突出していないという主張は取り下げたらいい。
それとも、まだ突出していないと思ってるとか？

71 ：

>>69
俺は別に何も主張するつもりは無いよ。
個々の薬害にはそれ相応の背景があるんだろ。
ただね、何も分かっていないのに「利権だ」って叫べば世の中に通じているような錯覚もってるのは
端から見ていて「あ、こいつは無能な貧乏人だ」って思われるだけなんだよ。
正直、あんたが痛々しい。

72 ：

>>70
突出はしていないだろ？
パRが突出していて、インターネットがそれに次ぐ。
製薬は明らかにそれよりも数段落ちる。次の携帯業界と近い。
トップ集団ではあるけれど、それを「突出している」というのなら
インターネットも携帯も「突出している」ということになる。
では、その「突出している」ことに意味があるの？といえば、単に高利益率な体質なんだね、としかいえない。
製薬業が不景気に強いとかいうのは昔から言われていることで、別に不思議なことじゃない。

73 ：

>>71
ok
> 俺は別に何も主張するつもりは無いよ。
釣り師確定な。
釣り師に説明するのがもったいだけ。

74 ：

おまえら陰謀論は別のところでやれ
激しく板違い

75 ：

ちなみに、業界の利益率の偏差値で優劣を判断するのは意味が無い。
なぜなら、業界によっては「薄利多売」か「少量高付加価値」かのような違いがあるからね。
同じ価値観で同じ内容の偏差値を競う学生のテストの点とは違うんだよ。

76 ：

バカはほっといて、ちら裏に書いとくかｗ
なぜ製薬業界の利益率が突出していることが問題か
薬価によって利益率が影響を受けるから

77 ：

突出してるかどうかと、利益構造をごっちゃにしちゃうなんて、いやはやｗ

78 ：

あとな、>>70は多分、学生なんだろうけど、
＞一位に数％負けている
じゃないよ。
10％前後の利益率のところで２％の差があるってことは「2割の違いがある」ってことだよ。
ま、テスト頑張りな。

79 ：

ﾋｨｨｨｨ 腹筋壊れる

80 ：

>>20
ん？そういう話だっけ？
PG9は、HIVが持つ抗原認識回避の原因どころの
可変領域のv遺伝子群からどれを引っ張り出しても
関係なく中和する機能があるってことじゃ？
まぁ正直あんま理解しきれないのだがw

81 ：

可変領域の〜 じゃなく可変領域で使う に訂正w
遺伝子はそこにはねぇわw

82 ：

俺の株も矮小化したままなんだが
ままなんだが!

83 ：

>>80
それであってるよ
なんで中和できるのかっていうメカニズムが分かった
ってことが書いてある

84 ：

>>80
それであってるよ
なんで中和できるのかっていうメカニズムが分かった
ってことが書いてある

85 ：

だが、子供用のエイズ薬はできない。

86 ：

下がりきった株も中和できますか？

87 ：

ウイルスが抗体に認識されるのを防ぐためにくっつくところをgp120っていう
カバーで覆ってる。カバーは、いっぱい種類があるからウイルスがなかなか倒せないよ。
このカバーに関係なくくっつくＰＧ１２０って言うのを使って
どんな構造してるかみてみたよってこと？
あと、中和っていう言葉がいまいちよくわからなかった。

88 ：

>>87
PG9か。間違えた。

89 ：

>>87
ちょっとちがう。
いっぱい種類があるのはgp120。
カバーされているところは攻撃しづらいから、カバーされてないところを攻撃したいが、
そう言うところはいろんなバリエーションを持っていて、抗体がそれを認識して攻撃できなかった。
このPG9はカバーをかいくぐり、さらに逆にカバーをも利用してgp120を認識する。
中和とは、ウイルスの攻撃能力をなくすこと。無力化。

90 ：

あと、カバーというのはgp120に結合している糖鎖…Ｎ結合型グリカンのこと。
タンパク質は基本、1本のアミノ酸が連結したヒモがこんがらがって構造を作っていて、
そのヒモの両端をそれぞれＮ末、Ｃ末というが、
そのうちＮ末に糖鎖を結合させている。
構造を見てないからＣ末側はどうなってるのか分からないけど、
文章からみておそらく、可変領域V1/V2っていうのがあるんだろうな。

91 ：

>>89
中和は不活化と同じ意味なのかな？

92 ：

>>90
横からごめん。N結合型グリカンはN末端ではなくて、
アスパラギンってNを二つ持ってるアミノ酸にくっつくみたいよ。
だからgp120のなかのアスパラギンさんから毛みたいに
ぼーぼー生えてるイメージではないかと。
>91
同じ意味ではないかね。抗体がくっつくことにより感染力が
喪われるという意味で。

93 ：

>>1
あと一歩で治りますね。頑張れ！

94 ：11/12/31

どうせ完治はせん